为服务中国石油大学（华东）两校区办学结构调整和国家黄蓝战略批复实施的需要，学校于2009年4月成立建设科学技术研究院（简称科学院）。多年来，科学院秉持“厚重科学，务实创新”的理念，推进学校科学研究与区域经济发展融合，提升科学院服务学校、服务石油石化行业、服务区域社会发展的能力，目标实现科学院内涵发展、特色发展和可持续发展。2012年获评山东省技术市场科技金桥奖先进集体，2022年获评东营市“创新实干、事争一流”单项工作（油地融合）先进集体，2023年再次获评东营市“全市高质量发展创新实干先进集体”。

       科学院现有在编职工6人，其余各类科研人员200余人。建有院士工作站创新团队1个、山东省泰山学者创新团队1个、中国侨界贡献奖创新团队1个和黄河三角洲学者创新团队1个。

       科学院立足东营科教园区，有效利用学校的资源优势，推进校企联合科研，集聚科研力量，逐步完善以服务地方经济和行业发展的技术服务体系。目前与15家企业共建含勘探、开发、增产、控制、环境、化学、检测等12个专业研究机构（实验室）。

       2013年以来，科学院共承担国家自然科学基金，国家级重大专项、省部级重大专项，市局校级各类课题。先后有“碳酸盐岩油气藏转向酸压技术与工业化应用”获国家技术发明奖二等奖，“高效原油降解素研发与工业应用”、“油田含油污水资源化处理关键技术研究与产业化应用”、“建筑能耗闭环控制系统研发及应用”等项目获中国技术市场协会、环保部、山东省、中国石油和化学工业协会等省部级奖励。

       在2017年学校机构调整后，科学技术研究院更名为“东营科学技术研究院”。2020年中国石油大学（华东）、东营市人民政府、胜利石油管理局有限公司三方签署共建“东营科学技术研究院”协议，推进科学院进一步发展相关学科领域，整合优势资源，提升科技服务能力。东营科学技术研究院将深入贯彻学校创新发展要求，抓住油地校三方共建机遇，珍惜荣誉，攻坚克难，内涵发展。有效利用校内外资源，为区域经济社会高质量发展提供更高水平的人才科技服务，成为学校“服务山东”的东营名片。